Research interests

• Parallel and distributed computing

• Heterogeneous computing

• Scheduling

• Biomedical Engineering

Publications   Up

• J. Barbosa, J. Tavares and A.J. Padilha: “Optimizing dense linear algebra algorithms on heterogeneous machines”, Algorithms and Tools for Parallel Computing On Heterogeneous Clusters, Nova Science Publisher, N.Y., pp 17-31, 2007. (Book Chapter)

• J. Barbosa, C. Morais, R. Nobrega, A.P. Monteiro: “Static scheduling of dependent parallel tasks on heterogeneous clusters”, 4th International Workshop on Algorithms, Models and Tools for Parallel Computing on Heterogeneous Networks, IEEE CS Press, Boston, pp. 1-8, 2005.

• C. Morais, J. Barbosa, P. Tadeu: “Data parallel scheduling of Operations in Linear Algebra on heterogeneous clusters”, WSEAS Transactions on Computers, Issue 10, Volume 4, ISSN 1109-2750, pp. 1440-1448, October 2005.

• J. Barbosa, C. Morais, A.P. Monteiro: "Scheduling parallel tasks on heterogeneous clusters", IASTED International Conference on Parallel and Distributed Computing and Systems, Cambridge, 2004.

• J. Barbosa, C. Morais, A.J. Padilha: "Simulation of data distribution strategies for LU factorization on heterogeneous machines", Proc. of 12th Heterogeneous Computing Workshop, IEEE CS Press, Nice, 2003.

• J. Barbosa, J.Tavares, A.J. Padilha: "A Group Block Distribution Strategy for a Heterogeneous Machine", Proceedings of the IASTED International Conference Applied Informatics, Innsbruck, 2002.

• J. Barbosa, J.Tavares, A.J. Padilha: "Self-Tuned Parallel Processing System for Heterogeneous Clusters", International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications, PDPTA, H. R. Arabnia (Ed.), CSREA Press, Las Vegas, 2001.

• J. Barbosa, J.Tavares, A.J. Padilha: "Parallel Image Processing System on a Cluster of Personal Computers", VECPAR2000, Porto, 2000. Best Student Paper Award.

• J. Barbosa, Tavares, A.J. Padilha: "Linear Algebra Algorithms in a Heterogeneous Cluster of Personal Computers", 9th Heterogeneous Computing Workshop, pp. 147-159, IEEE CS Press, Cancun, 2000.

• J. Tavares, J. Barbosa, A.J. Padilha: "Matching image objects in dynamic pedobarography", RECPAD 2000, Porto, 2000.

• J. Barbosa, J.Tavares, A.J. Padilha: "Algorithm-Dependant Method to Determine the Optimal Number of Computers in Parallel Virtual Machines", VECPAR 98, Porto, 1998.

Students   Up

• PhD Students
  • Daniel C. Moura, ProDEI, "Three-Dimensional Biplanar Reconstruction of the Scoliotic Spine for Standard Clinical Setup", January 2011.
  • Tito Vieira, ProDEI, "Ambientes de Computação de Elevado Desempenho Virtuais em Infra-Estruturas Heterogéneas", expected to 2013.
  • Tiago Santos, ProDEI, "Uncoordinated checkpointing with distributed message logging and recovery in modern clusterns", expected to 2013.
  • Altino Sampaio, ProDEI, "Autonomic computing algorithms for self-healed cloud computing environments", expected to 2013.
  • Hamid Arabnejad, MAPi, "Optimal multi-user job scheduling on heterogeneous platforms", expected to 2014.
• MSc Students
  • Tiago Gomes, MIEIC, "Sistema de apoio à decisão para gestão de negócio em tempo real baseado em RFID", July 2011.
  • Manuel Magina, MIEIC, "Sistema de monitorização e apoio à decisão no tratamento de úlceras de pressão", July 2011.
  • Bruno Rodrigues, MIEEC, "Classificação automática de lesões cutâneas", July 2011.
  • Nuno Cardoso, MIEIC, "Virtual clusters sustained by cloud computing infrastructures", July 2011.
  • Carlos Sousa, MIEIC, "Plataforma de suporte à criação colaborativa de conteúdos", July 2011.
  • André Cardoso, MIEIC, "Generation of planar radiographs from 3D anatomical models using the GPU", February 2011.
  • Girson Monteiro, MIEIC, "Computação voluntária", July 2010.
  • Jorge Pinheiro, MIEIC, "Interligação de infra-estruturas de computação de elevado desempenho heterógeneas recorrendo a um super-escalonador", March 2010.
  • Belmiro Moreira, MIEIC, "Optimização do tempo de processamento de aplicações em clusters em ambiente multi-utilizador", March 2009.
  • Bruno Figueiredo, Mestrado Engenharia Biomédica, "Quantificação Automatica da Gordura Epicárdica em Imagens de Tomografia Computorizada", April 2009.
  • Ricardo J. Moreira Teixeira, MIEEC, "Integrated Security Sub-System for IPBrick", iPortalMais, 2008.
  • Bruno M. F. Pereira, MIEEC, "Sistema de Backup Distribuído para IPBrick", iPortalMais, 2008. 
  • Jorge Gonçalves, Mestrado Engenharia Biomédica, "Software para processamento e análise de imagem médica: comparação e especificação ", July 2005.
  • Celeste Morais, Mestrado em Métodos Computacionais em Ciência e Engenharia, "Escalonamento de tarefas numa máquina paralela heterogénea e sua disponibilização remota", January 2004.
• Final year projects
  • Michael Troquier, Training Course, Université de Nantes, "Development of an interface to submit jobs on a cluster", August 2009.
  • Maria Inês Pires Carvalho, Estágio LEEC, “Jogo Interactivo para Controlo da Tonalidade da Voz”, FEUP, 2007.
  • Vítor Silva e Hugo Faria, Estágio LEEC, “Interface Local e Remota para Cozedores de Produtos Alimentares", FEUP e Realsabor, 2007.
  • Ricardo J. Moreira Teixeira, Estágio LEEC, “Desenvolvimento e Integração de um servidor Jabber com a IPBrick”, iPortalMais, 2007.
  • André Teixeira da Silva, Estágio LEEC, “Módulos de Comunicação Wireless”, Realsabor e FEUP, 2007.
• Sílvia Maria dos Santos Perfeito, Estágio LEIC, “Sistema de Informação – Portal Técnico INFOTEC”, EMEF, 2007.
• André David Leite de Melo, Projecto Fim de Curso LEEC, “Controlo de Temperaturas no Transporte de Alimentos”, FEUP e Realsabor, 2006.
• Rui André Ferreira, Estágio LEIC, “edgeBOX Testing Engineer”, CRITICAL Software, 2006.
• António Pedro Costa, Estágio LEIC, “Reconhecimento de Escrita em TabletPC’s e Implementação de um Sistema de Indicadores de Gestão”, CPC-HS, 2006.
• João Paulo Castro Mendes, Estágio LEIC, “Editor Gráfico da Rede Eléctrica – Conectividade”, EFACEC Sistemas de Electrónica, 2006.
• Tiago Lousada Soares, Projecto Fim de Curso LEEC, “Visualização 3D do movimento humano para aplicações em Biomecânica”, INEB, 2005.
• Hugo Daniel Ferreira Almeida, Estágio LEIC, “Sistemas de Apoio a Análise de Performance”, IT PEERS, 2005.
• Nuno Ricardo Araújo Alves, Estágio LEIC, “Auditorias a pontos de venda na UNICER – Bebidas de Portugal, SGPS SA”, UNICER, 2005.
• Milton Omar Pereira Abreu, Estágio LEIC, “Sistema de suporte a informação geográfica para aplicações multimédia”, Porto Editora, 2004.

Theses   Up

• PhD Thesis: "Paralelismo em Processamento e Análise de Imagens Médicas", FEUP, January 2001.(pdf)

• MSc Thesis: "High speed signal measurement and demodulation in electrical impedance tomography using a low cost DSP", UMIST, Manchester, December 1993.

Patents   Up

• “Device to monitor and register the transport and storage temperature of temperature-sensitive products and method thereof”, Jorge G. Barbosa, André Melo, Miguel Velhote, M. Fernandes.
  PATENT No. WO 2008/093282 A2, Publication date 03-11-2008.

Projects   Up

• ComplexHPC - Open European Network for High Performance Computing on Complex Environment.

  Coordenador: Emmanuel Jeannot, Institut National de Recherche en Informatique et Automatique.

  Instituições Participantes Portuguesas: Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto, Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores - INESC ID Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, Universidade do Minho. Envolve 31 participantes de 16 países.

  Financiamento: COST Action IC0805, 724,5 K€.

  Duração: 5 anos, iniciado em 2009.

• Servidores Locais e Remotos para Análise de Imagem Médica e Biológica e para Visão Computacional

  Coordenador: Aurélio Campilho, do Instituto de Engenharia Biomédica.

  Instituições Participantes: Instituto de Engenharia Biomédica.

  Financiamento: Programa Nacional de Re-equipamento Científico (PNRC) CONC-REEQ/738/EEI/2005, 200 K

  Duração: 36 meses, iniciado em Janeiro 2005.

• BING - Rede Grid de Imagiologia Cerebral

  Coordenador: António Sousa Pereira, da Universidade de Aveiro.

  Instituições Participantes: Universidade de Aveiro (proponente), Instituto de Engenharia Biomédica, Faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra, Universidade do Minho.

  Financiamento: I&DT - Projectos de I&DT em Todos os Domínios Científicos, GRID/GRI/81833/2006, 113 K€.

  Duração: 36 meses, iniciado em Abril 2007

• GERES - med: repositórios em GRID para aplicações médicas

  Coordenador: António Sousa Pereira, da Universidade de Aveiro.

  Instituições Participantes: Universidade de Aveiro (proponente), Instituto de Engenharia Biomédica, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, Hospital Geral de Santo António, SA (HGSA), Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa (FM/UL), Centro Hospitalar de Vila Nova de Gaia (CHVNG).

  Financiamento: FCT/CERN - Acordo Cooperação Portugal/CERN, 137 K€.

  Duração: 36 meses, iniciado em Setembro de 2007.

• ACTIDEF - Avaliação Computacional e Tecnológica Integrada do Desempenho e Funcionalidade de Cidadãos com Incapacidades Músculo-esqueléticas

  Coordenador: Jerónimo de Sousa, do Centro de Reabilitação Profissional de Gaia.

  Instituições Participantes: Centro de Reabilitação Profissional de Gaia (proponente), Instituto de Engenharia Biomédica, Instituto de Engenharia Mecânica e Gestão Industrial.

  Financiamento: Programa Operacional Sociedade do Conhecimento (ref. 242/4.2/C/REG), Medida 4.2 – “Dinamizar a Produção de Conteúdos e Aplicações de Banda Larga”, 150 K€.

  Duração: 12 meses, iniciado em Fevereiro de 2006.  

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• Segmentação, Seguimento e Análise de Movimento de Objectos Deformáveis (2D/3D) usando Princípios Físicos

  Tipo de Participação: Investigador do Instituto de Engenharia Biomédica.

  Coordenador: João Manuel R. S. Tavares

  Instituições Participantes: Instituto de Engenharia Mecânica e Gestão Industrial (proponente), Instituto de Engenharia Biomédica

  Financiamento: Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Concurso para Projectos de Investigação Científica e Desenvolvimento Tecnológico 2004 (ref. POSC/EEA-SRI/55386/2004), 63.4 K€

  Duração: 36 meses, iniciado em Maio de 2005.  

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• Development of an infra-structure to support parallel and distributed computing over a heterogeneous computer network

  Participantes: Jorge Barbosa, A.P. Monteiro, Fréderic Hustinx

  Financiamento: INEB

  Duração: 12 meses, iniciado em Março de 2004.  

• Quality inspection of optical WORM disks

  Participantes: (for this particular application) A.J. Padilha, A.C. Campilho, J. Barbosa.

  Financiamento: EC (Esprit IV 24003)

  Duração: 12 meses, iniciado em 1996.