O Laboratório de Hidráulica foi criado no ano de 1961, com a finalidade de dar apoio à docência através da realização de aulas laboratoriais e permitir o desenvolvimento de projetos de investigação existentes no âmbito das Linhas de Ação do Instituto de Alta Cultura. Em 1990/1993 através dos programas Ciência-Praxis (Medida M) obteve verbas que lhe permitiram reapetrechar-se no Campo da Mecânica dos Fluidos Experimental, adquirindo vários equipamentos para realização de medidas em escoamentos, com utilização de técnicas como a Anemometria Laser Doppler e outras. No projeto de candidatura colaboraram para além de Investigadores do Departamento de Engenharia Civil - Secção de Hidráulica, Recursos Hídricos e Ambiente, Investigadores dos Departamentos de Engenharia Mecânica e de Engenharia Química envolvidos no estudo de problemas relativos a Mecânica dos Fluidos. Estes Investigadores, hoje reunidos na unidade de Financiamento Plurianual CEFT, utilizam igualmente as instalações e o equipamento do Laboratório para desenvolvimento de vários dos seus projetos, alguns dos quais em colaboração com Investigadores do Departamento de Engenharia Civil. 
Assim o Laboratório de Hidráulica dá no âmbito da investigação apoio a investigadores da Secção de Hidráulica, Recursos Hídricos e Ambiente os quais na sua maior parte estão integrados na unidade de financiamento plurianual CEHRA e aos investigadores dos Departamentos de Mecânica e de Química anteriormente referidos e enquadrados na unidade CEFT. 
A sua atividade desenvolve-se em estreita ligação com a Secção de Hidráulica, Recursos Hídricos e Ambiente e em conjugação com o Instituto de Hidráulica e Recursos Hídricos, permitindo o desenvolvimento da parte experimental de vários projetos de investigação, dando apoio à realização de várias teses de mestrado e de doutoramento e facultando a possibilidade de realização de várias aulas para apoio à docência.