O modo WYSIWYG nem sempre é um retracto real da página, principalmente com o uso de alinhamentos em tabelas, células e CSS.
O modo de visualização (preview) incluído não corresponde a nenhum browser exactamente (nem permite a sua inclusão - como é o caso do Homesite) devendo pois ser testado em cada um deles.
O modo de procura e substituição de termos é somente página por página obrigando à abertura individual dos ficheiros, não possibilitando assim uma troca rápida de expressões. A versão seguinte (XP), já disponível em Versão Beta já permite a troca em ficheiros múltiplos mas somente de uma linha, não chegando ao poder da substituição fornecido pelo Homesite.
O uso de instruções do tipo <div> e posicionamento pelo uso de CSS não é apoiado pelo modo WYSIWYG.
O modo de edição em linha (HTML) não tem ajuda nos comandos e este modo é necessário para muitas correcções que não são possíveis no modo de edição WYSIWYG (normal)
Não fornece nenhuma ferramenta de apoio para a construção de CSS
produz muitos ficheiros que podem não ser usados (por exemplo pelo uso de temas) o que pode fazer ultrapassar a quota disponível.
o modo de publicação possibilita a publicação das somente das alterações, mas estas são verificadas pela comparação dos ficheiros o que torna esta opção morosa. Na versão XP será também possível o uso do TimeStamp para detectar as alterações.
Quando se faz "cut-paste" o Frontpage tenta usar as fontes de origem o que pode não ser o que queremos. a versão XP usando o novo sistema de "cut-paste" do Office XP permite a copia do texto sem formatações.
Não permite a gravação de todos os ficheiros abertos (Save All). A versão seguinte já possuirá essa opção.
Não verifica se nome dos ficheiros é compatível com o sistema Unix
O FrontPage deixa a sua assinatura nas páginas que edita (2 linhas em <meta>) o que pode ser considerado uma tentativa de violação de privacidade
O produto implica o uso do Office.